烟草良种繁育工作包括两方面的任务，一是利用先进农业技术，繁殖已经审定推广的优良品种，满足生产所需要的种子；二是保持与提高优良品种的纯度和种性，不使品种产生混杂退化而降低烟叶的产量和质量。
1．建立种子管理制度
为了在生产上及时更新品种，迅速推广良种，从根本上防止良种混杂退化，不断提高良种种性，在烟草产区必须建立健全良种繁育推广体系，把品种的试验示范、评议审定、繁殖推广和经营管理等环节连成一个整体。
（1）良种试验示范：良种区域试验是育种工作的重要组成部分，也是品种选育与推广工作的中间环节。将新品种（系）在条件差别较大的地区进行多点试验，能较准确地鉴定出品种的适应地区、使用价值和栽培调制特点等，为优良品种推广利用和区域化种植提供科学依据。
（2）良种审定与推广：烟草新品种育成并经过区域试验和生产示范后，还需通过严格的评议审定，才能在生产上正式推广。负责审定工作的机构是全国烟草品种审定委员会或省烟草品种审定委员会。该机构的主要职责是执行和监督国家发布的有关烟草种子的方针政策，制定种子繁育推广和经营管理制度，负责组织品种区域试验和良种审定工作等。
（3）种子繁育体系：烟草种子小，繁殖系数大，1亩种子田可繁殖10公斤左右种子。烟草良种繁育应根据其繁殖系数大的特点，做到手续简，效果好。我国目前实行“原种一良种”两级繁育程序，贯彻“四化一供”的种子工作方针，即实行种子生产专业化、种子加工机械化、种子质量标准化、品种布局区域化、统一组织种子供应。烟草原种原则上由选育单位或引进单位负责繁育和供应，也可由全国烟草品种审定委员会指定有关科研单位负责繁育与供应。良种一般由省级生产主管部门组织良种场、科研单位或有条件的农户负责繁育，统一供应。原则上实行省内自繁自供，不宜乱拨乱调。负责繁育单位必须保证种子纯度和质量，因种子不符合质量标准而造成损失者，应追究有关繁种和供种单位的责任，直至经济赔偿。 $page$
2．品种的混杂退化与提纯复壮
任何作物的品种都是自然选择和人工选择同时作用的产物，因而只有在环境条件适宜和人工选择不断进行的情况下，才能保持品种种性的稳定。烟草品种引进种植或当地栽培多年而未能进行认真的选株留种，或者由于环境条件不适宜，往往使良种种性发生变异。良种变异多数是朝着降低经济性状的方向变化，常表现为叶片或多或少，叶形有窄有宽，抗病力或抗逆性衰退，导致产量降低，品质变劣等。混杂退化的原因主要有机械混杂、自然杂交、种株选择不当、环境条件改变等。这些原因有时一个在起作用，有时多个起作用，表现为相互联系，相互影响。烟草良种的提纯复壮，是克服混杂退化的有效途径，也是提高良种种性、延长良种使用年限、充分发挥良种增产效益的有效途径。杂与纯、退化与复壮是可以相互转化的，只要采取相应的技术措施，完全可以使种子由杂转纯，由退化转复壮。目前普遍采用的提纯复壮方法是分系选择法，这种方法程序简便，效果良好。包括单株选择、分系比较、混系繁殖3个步骤。
3．烟草原种的生产
原种是指育成品种的原始种子，也指经过提纯选优具有该品种典型性的种子，是良种繁育的基础材料。原种的质量标准特别高，要求纯度99％以上，净度99％以上，发芽率95％以上，籽粒均匀饱满、搓捻无粉屑、深褐色、色泽一致。原种一般由该品种的育成单位、原种场或指定单位负责生产，生产的数量和方法视推广面积和种子田面积而定。
烟草良种在生产上推广几年后，为避免出现混杂退化现象，需用提纯复壮法生产原种。生产原种的方法繁简不一，可根据实际而定。目前较多采用的方法是混合选择法，适用于混杂退化不严重的品种和技术条件较差的单位。混杂退化较重的品种或繁育条件较好的单位，最好采用分系选择法。
混合选择法是在某品种相对整齐的群体中（一般是在种子田），选择具有该品种典型性状的健壮植株，使其严格自交，蒴果成熟后混合起来脱粒，下年边鉴定边供应种子田使用。
分系选择法也叫改良混合选择法。此法的程序可概括为单株选择、分系比较、混系繁殖，也就是所谓的“两年一圃制”。第一年广泛选择单株，第二年进行株系间的比较鉴定（鉴定圃），并把各个入选株系的种子混合起来，成为良种。
混系繁殖是指将株行圃入选株行采收的种子混合起来，进一步在原种圃里繁殖原种。由于烟草种子繁殖系数大，一般株行圃采收的原种就足够种子田的需要，所以通常勿需再进一步繁殖原种。如原种需要量大，或计划该批原种要使用多年，那就要在原种圃里进一步繁殖原种。$page$
4．烟草良种繁育
（1）种子田的规划与栽培特点：烟草生产用种子一般以省为单位组织繁殖，面积较大的地区或县也可以组织。各省级单位要集中建立种子田，实行集中繁殖，以便能较长时间地保持品种本来的群体结构。每百亩烤烟只需要高质量的种子0.5公斤，因此一般每200（）亩烤烟只须设1亩种子田。繁殖单位应根据生产面积确定种子田的面积。种子田的选择，除要求土质肥沃、地力均匀、实行轮作、排灌方便和便于管理外，还要注意保持品种之间一定的空间距离，通常应在500米以上，以防止品种间自然杂交。一个承担繁种单位只宜繁殖1个品种，而且其周围最好只种植与种子田相同的品种。 种子田的记载管理，应根据种子成熟的需要确定适当的播种期和移栽期，以免过早低温而早花或过晚受霜冻危害，影响种子质量。育苗时，苗床的土壤、基肥、用具等都不能带有烟种，以免混杂；移栽和补苗时应严格避免混栽其他品种的烟苗。移栽密度要比一般生产田适当地小；施肥水平要高于一般生产田，以氮肥为主，配合适量的磷、钾肥。留种烟株的叶片应适当晚采，否则因营养不足或蒴果未能充分成熟而降低种子产量和质量。
（2）种株选择与花果控制：种子田一般采用严格去杂去劣的选择方法，不具备本品种特征特性的混杂株、变异株、病株、劣株，一概提早打顶，保证种子有较高的纯度。选留种株以具备本品种典型性为主要标准，一般在现蕾前进行第一次去杂去劣，大约半月后烟株将烟进入开花期时进行第二次去杂去劣。以后发现杂株、劣株要随时打顶，不使被淘汰的烟株有开花传粉的机会。一般纯度较高、病害较轻的种子田可选留70～80％的植株。种子田内如发现个别植株表现优异，但其性状又明显偏离了该品种的典型性，应套袋自交，并将种子个别收获，作为育种材料供下年继续观察。
留种烟株必须控制花果数目，进行疏花疏果，使蒴果成熟一致，提高种子质量。据研究，3～6天开的花种子质量最好，到12天以后开的花种子质量逐渐下降。因此，通常只保留最初两周内开花的大约60个花果，以获得质量较好的种子，其他花果应疏掉。从花果的部位来看，由最顶端的三叉花枝向下数至第五花枝，以及每一花枝的第五分叉点以里，是保留花果的适宜部位，其余花枝和保留花枝的末梢都可剪去。 $page$
烟草从开花到种子成熟需1个月左右的时间。通常情况下，当果穗的大约半数蒴果呈褐色，其余蒴果也开始转褐时为适宜采收期。采下的果穗经晒晾至全部干燥时脱粒，并用风选或水选除去杂质和秕粒，也可用种子精选机选种。
（3）种子质量及其检测：种子质量是指种子品种纯度、发芽率、含水量、成实饱满度和杂草种子含量等。烟草种子质量项目，有的是在烟草生育期进行田间检查，有的是在室内进行种子检测。不合格的种子禁止入库或发放使用。全国烟草种子管理条例（草案）对烟草种子分级标准规定见表1。
（4）种子贮藏：种子贮藏的目的是控制环境条件，保持种子良好的生命力，并做到无虫害、无鼠害、无霉变，保证种子纯度与净度，延长种子的寿命。干燥和低温是保证种子安全贮藏、延长寿命的基本条件。据研究，10％相对湿度是保持种子发芽率的最好湿度，在此环境里贮存的种子，15年后仍有75％的生命力。而贮存在一般实验室条件下不到两年种子发芽率就急剧下降。因此，生产用种子的贮藏最好不超过两年。南方烟区气候高温高湿更应如此。贮存期间应根据气候情况，定期曝晒，以保持种子干燥。 种子入库与管理应有专人负责，不同品种和不同等级的种子应有清楚的标记，分别存放和曝晒。种子发放前最好统一消毒，以清除种皮上可能携带的病菌。种子袋上应注明品种名称、级别、繁殖单位、采种年份、检验单位等。